Filippo Zapponi est diplômé en composition des conservatoires de Côme et Strasbourg, où il a été l’élève d’Ivan Fedele. Il s’est ensuite formé auprès de Brian Ferneyhough (Fondation Royaumont et Centre Acanthes), Karlheinz Stockhausen (Stockhausen Courses Kürten, Stockhausen-Stiftung für Musik, Allemagne), ainsi qu’à l’Ircam de Paris. Il a également obtenu un Master II Recherche en Musicologie (Université de Strasbourg). Lauréat de plusieurs concours, il a notamment remporté le 1^er prix du prestigieux Concours International de Composition « Festival Pablo Casals » à Prades, en 2015.
Ses œuvres sont interprétées dans le monde entier (de l’Europe aux États-Unis, Chine et Australie) par des artistes de renommée internationale et elles sont publiées par BabelScores. Filippo Zapponi est professeur d’enseignement artistique titulaire de composition, analyse et orchestration au Conservatoire à Rayonnement Régional Gabriel Pierné de l'Eurométropole de Metz.